Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms