Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms