Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms