Protein–RNA interactions for Protein: P50120

RBP2, Retinol-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP2P50120 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBP2P50120 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RBP2P50120 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBP2P50120 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBP2P50120 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBP2P50120 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBP2P50120 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBP2P50120 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBP2P50120 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBP2P50120 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBP2P50120 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RBP2P50120 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBP2P50120 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBP2P50120 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBP2P50120 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBP2P50120 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBP2P50120 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBP2P50120 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBP2P50120 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RBP2P50120 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBP2P50120 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBP2P50120 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBP2P50120 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBP2P50120 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBP2P50120 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBP2P50120 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBP2P50120 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP2P50120 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP2P50120 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP2P50120 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP2P50120 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP2P50120 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP2P50120 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP2P50120 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP2P50120 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP2P50120 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP2P50120 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP2P50120 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP2P50120 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP2P50120 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP2P50120 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP2P50120 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP2P50120 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP2P50120 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP2P50120 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP2P50120 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP2P50120 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP2P50120 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP2P50120 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP2P50120 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP2P50120 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP2P50120 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP2P50120 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP2P50120 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP2P50120 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP2P50120 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP2P50120 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP2P50120 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP2P50120 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP2P50120 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP2P50120 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP2P50120 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP2P50120 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP2P50120 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP2P50120 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP2P50120 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP2P50120 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP2P50120 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP2P50120 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP2P50120 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP2P50120 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP2P50120 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP2P50120 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP2P50120 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP2P50120 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP2P50120 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBP2P50120 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBP2P50120 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBP2P50120 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBP2P50120 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RBP2P50120 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBP2P50120 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBP2P50120 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBP2P50120 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBP2P50120 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBP2P50120 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBP2P50120 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBP2P50120 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBP2P50120 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBP2P50120 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBP2P50120 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBP2P50120 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBP2P50120 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBP2P50120 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBP2P50120 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBP2P50120 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBP2P50120 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RBP2P50120 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBP2P50120 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RBP2P50120 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms