Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ME1P48163 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ME1P48163 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ME1P48163 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ME1P48163 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ME1P48163 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ME1P48163 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ME1P48163 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ME1P48163 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ME1P48163 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ME1P48163 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ME1P48163 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ME1P48163 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ME1P48163 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ME1P48163 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ME1P48163 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ME1P48163 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ME1P48163 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ME1P48163 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ME1P48163 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ME1P48163 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ME1P48163 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ME1P48163 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ME1P48163 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ME1P48163 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ME1P48163 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ME1P48163 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ME1P48163 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ME1P48163 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ME1P48163 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ME1P48163 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ME1P48163 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ME1P48163 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ME1P48163 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ME1P48163 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ME1P48163 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ME1P48163 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ME1P48163 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ME1P48163 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ME1P48163 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ME1P48163 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ME1P48163 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ME1P48163 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ME1P48163 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ME1P48163 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ME1P48163 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ME1P48163 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ME1P48163 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ME1P48163 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ME1P48163 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ME1P48163 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ME1P48163 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ME1P48163 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ME1P48163 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ME1P48163 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ME1P48163 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ME1P48163 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ME1P48163 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ME1P48163 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ME1P48163 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ME1P48163 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ME1P48163 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ME1P48163 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ME1P48163 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ME1P48163 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ME1P48163 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ME1P48163 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ME1P48163 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ME1P48163 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ME1P48163 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ME1P48163 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ME1P48163 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ME1P48163 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ME1P48163 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ME1P48163 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ME1P48163 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ME1P48163 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ME1P48163 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ME1P48163 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ME1P48163 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ME1P48163 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ME1P48163 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ME1P48163 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ME1P48163 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ME1P48163 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ME1P48163 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ME1P48163 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ME1P48163 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ME1P48163 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ME1P48163 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ME1P48163 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ME1P48163 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ME1P48163 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ME1P48163 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ME1P48163 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ME1P48163 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ME1P48163 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ME1P48163 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ME1P48163 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ME1P48163 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms