Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms