Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms