Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLNP26678 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLNP26678 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PLNP26678 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLNP26678 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLNP26678 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLNP26678 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLNP26678 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLNP26678 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLNP26678 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLNP26678 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLNP26678 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLNP26678 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLNP26678 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLNP26678 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLNP26678 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLNP26678 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLNP26678 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLNP26678 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLNP26678 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLNP26678 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLNP26678 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLNP26678 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLNP26678 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLNP26678 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLNP26678 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLNP26678 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLNP26678 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLNP26678 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLNP26678 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLNP26678 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLNP26678 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLNP26678 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLNP26678 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLNP26678 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLNP26678 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLNP26678 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLNP26678 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLNP26678 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLNP26678 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLNP26678 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLNP26678 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLNP26678 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLNP26678 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLNP26678 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLNP26678 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLNP26678 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLNP26678 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PLNP26678 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLNP26678 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLNP26678 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLNP26678 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLNP26678 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLNP26678 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLNP26678 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLNP26678 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLNP26678 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLNP26678 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLNP26678 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLNP26678 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLNP26678 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLNP26678 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLNP26678 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLNP26678 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLNP26678 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLNP26678 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLNP26678 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLNP26678 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLNP26678 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLNP26678 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLNP26678 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLNP26678 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLNP26678 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLNP26678 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLNP26678 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PLNP26678 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLNP26678 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLNP26678 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLNP26678 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PLNP26678 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PLNP26678 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLNP26678 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PLNP26678 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLNP26678 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLNP26678 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLNP26678 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLNP26678 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLNP26678 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLNP26678 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PLNP26678 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PLNP26678 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLNP26678 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLNP26678 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLNP26678 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PLNP26678 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PLNP26678 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PLNP26678 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLNP26678 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PLNP26678 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLNP26678 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms