Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDCP20941 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDCP20941 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PDCP20941 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDCP20941 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDCP20941 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDCP20941 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDCP20941 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDCP20941 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDCP20941 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDCP20941 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PDCP20941 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PDCP20941 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PDCP20941 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDCP20941 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDCP20941 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PDCP20941 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDCP20941 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDCP20941 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDCP20941 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDCP20941 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDCP20941 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDCP20941 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDCP20941 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDCP20941 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDCP20941 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PDCP20941 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDCP20941 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDCP20941 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDCP20941 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDCP20941 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDCP20941 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDCP20941 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PDCP20941 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDCP20941 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDCP20941 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDCP20941 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDCP20941 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDCP20941 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDCP20941 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PDCP20941 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PDCP20941 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDCP20941 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDCP20941 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDCP20941 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDCP20941 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDCP20941 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDCP20941 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDCP20941 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDCP20941 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDCP20941 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDCP20941 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDCP20941 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDCP20941 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDCP20941 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDCP20941 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDCP20941 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDCP20941 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDCP20941 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDCP20941 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PDCP20941 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDCP20941 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDCP20941 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDCP20941 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PDCP20941 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDCP20941 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PDCP20941 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDCP20941 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDCP20941 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCP20941 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCP20941 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCP20941 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCP20941 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCP20941 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCP20941 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCP20941 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCP20941 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCP20941 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCP20941 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCP20941 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCP20941 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCP20941 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCP20941 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCP20941 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCP20941 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCP20941 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDCP20941 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDCP20941 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDCP20941 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDCP20941 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PDCP20941 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDCP20941 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDCP20941 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDCP20941 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDCP20941 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDCP20941 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDCP20941 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDCP20941 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDCP20941 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDCP20941 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms