Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCNA2P20248 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCNA2P20248 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCNA2P20248 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCNA2P20248 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCNA2P20248 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNA2P20248 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNA2P20248 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNA2P20248 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNA2P20248 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms