Protein–RNA interactions for Protein: P17677

GAP43, Neuromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAP43P17677 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GAP43P17677 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GAP43P17677 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GAP43P17677 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GAP43P17677 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GAP43P17677 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GAP43P17677 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GAP43P17677 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAP43P17677 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAP43P17677 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAP43P17677 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAP43P17677 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAP43P17677 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAP43P17677 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAP43P17677 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAP43P17677 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAP43P17677 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAP43P17677 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAP43P17677 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAP43P17677 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GAP43P17677 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GAP43P17677 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAP43P17677 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAP43P17677 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAP43P17677 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAP43P17677 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GAP43P17677 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GAP43P17677 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GAP43P17677 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GAP43P17677 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GAP43P17677 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GAP43P17677 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GAP43P17677 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GAP43P17677 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GAP43P17677 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GAP43P17677 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GAP43P17677 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GAP43P17677 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GAP43P17677 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GAP43P17677 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GAP43P17677 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GAP43P17677 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GAP43P17677 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GAP43P17677 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GAP43P17677 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GAP43P17677 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GAP43P17677 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GAP43P17677 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GAP43P17677 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GAP43P17677 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GAP43P17677 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GAP43P17677 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GAP43P17677 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GAP43P17677 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GAP43P17677 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GAP43P17677 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GAP43P17677 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GAP43P17677 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GAP43P17677 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GAP43P17677 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GAP43P17677 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GAP43P17677 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GAP43P17677 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GAP43P17677 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GAP43P17677 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GAP43P17677 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GAP43P17677 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GAP43P17677 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GAP43P17677 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GAP43P17677 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GAP43P17677 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GAP43P17677 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GAP43P17677 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GAP43P17677 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GAP43P17677 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GAP43P17677 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GAP43P17677 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GAP43P17677 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GAP43P17677 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GAP43P17677 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GAP43P17677 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GAP43P17677 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GAP43P17677 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GAP43P17677 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GAP43P17677 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GAP43P17677 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GAP43P17677 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GAP43P17677 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GAP43P17677 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GAP43P17677 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GAP43P17677 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GAP43P17677 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GAP43P17677 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GAP43P17677 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GAP43P17677 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GAP43P17677 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GAP43P17677 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GAP43P17677 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GAP43P17677 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GAP43P17677 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms