Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms