Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ODC1P11926 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ODC1P11926 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ODC1P11926 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ODC1P11926 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ODC1P11926 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ODC1P11926 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ODC1P11926 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ODC1P11926 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ODC1P11926 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ODC1P11926 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ODC1P11926 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ODC1P11926 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ODC1P11926 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ODC1P11926 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ODC1P11926 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ODC1P11926 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ODC1P11926 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ODC1P11926 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ODC1P11926 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ODC1P11926 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ODC1P11926 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ODC1P11926 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ODC1P11926 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ODC1P11926 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ODC1P11926 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ODC1P11926 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ODC1P11926 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ODC1P11926 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ODC1P11926 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ODC1P11926 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ODC1P11926 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ODC1P11926 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ODC1P11926 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ODC1P11926 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ODC1P11926 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ODC1P11926 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ODC1P11926 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ODC1P11926 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ODC1P11926 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ODC1P11926 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ODC1P11926 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ODC1P11926 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ODC1P11926 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ODC1P11926 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ODC1P11926 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ODC1P11926 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ODC1P11926 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ODC1P11926 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ODC1P11926 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ODC1P11926 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ODC1P11926 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ODC1P11926 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ODC1P11926 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ODC1P11926 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ODC1P11926 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ODC1P11926 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ODC1P11926 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ODC1P11926 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ODC1P11926 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ODC1P11926 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ODC1P11926 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ODC1P11926 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ODC1P11926 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ODC1P11926 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ODC1P11926 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ODC1P11926 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ODC1P11926 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ODC1P11926 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ODC1P11926 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ODC1P11926 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ODC1P11926 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ODC1P11926 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ODC1P11926 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ODC1P11926 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ODC1P11926 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ODC1P11926 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ODC1P11926 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ODC1P11926 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ODC1P11926 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ODC1P11926 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ODC1P11926 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ODC1P11926 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ODC1P11926 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ODC1P11926 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ODC1P11926 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ODC1P11926 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ODC1P11926 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ODC1P11926 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ODC1P11926 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ODC1P11926 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ODC1P11926 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ODC1P11926 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ODC1P11926 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ODC1P11926 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ODC1P11926 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ODC1P11926 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ODC1P11926 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ODC1P11926 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ODC1P11926 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms