Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms