Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CD28P10747 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CD28P10747 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD28P10747 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD28P10747 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD28P10747 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD28P10747 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD28P10747 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD28P10747 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD28P10747 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD28P10747 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD28P10747 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD28P10747 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD28P10747 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD28P10747 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD28P10747 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD28P10747 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD28P10747 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD28P10747 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD28P10747 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD28P10747 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD28P10747 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD28P10747 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD28P10747 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD28P10747 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD28P10747 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD28P10747 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD28P10747 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD28P10747 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD28P10747 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD28P10747 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD28P10747 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD28P10747 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD28P10747 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD28P10747 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD28P10747 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD28P10747 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CD28P10747 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD28P10747 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD28P10747 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD28P10747 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD28P10747 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD28P10747 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD28P10747 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD28P10747 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD28P10747 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CD28P10747 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD28P10747 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD28P10747 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD28P10747 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD28P10747 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD28P10747 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD28P10747 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD28P10747 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD28P10747 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD28P10747 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD28P10747 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD28P10747 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD28P10747 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD28P10747 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD28P10747 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD28P10747 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD28P10747 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CD28P10747 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD28P10747 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD28P10747 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD28P10747 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD28P10747 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD28P10747 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD28P10747 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD28P10747 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD28P10747 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD28P10747 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CD28P10747 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD28P10747 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD28P10747 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD28P10747 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD28P10747 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD28P10747 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD28P10747 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD28P10747 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD28P10747 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD28P10747 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD28P10747 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD28P10747 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD28P10747 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD28P10747 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD28P10747 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD28P10747 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CD28P10747 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD28P10747 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD28P10747 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD28P10747 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD28P10747 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CD28P10747 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD28P10747 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD28P10747 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD28P10747 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD28P10747 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD28P10747 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms