Protein–RNA interactions for Protein: P0DJ93

SMIM13, Small integral membrane protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM13P0DJ93 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM13P0DJ93 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM13P0DJ93 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM13P0DJ93 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM13P0DJ93 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM13P0DJ93 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM13P0DJ93 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM13P0DJ93 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM13P0DJ93 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM13P0DJ93 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM13P0DJ93 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM13P0DJ93 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM13P0DJ93 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM13P0DJ93 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM13P0DJ93 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM13P0DJ93 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM13P0DJ93 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM13P0DJ93 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM13P0DJ93 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM13P0DJ93 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM13P0DJ93 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM13P0DJ93 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM13P0DJ93 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM13P0DJ93 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM13P0DJ93 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM13P0DJ93 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM13P0DJ93 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM13P0DJ93 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM13P0DJ93 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM13P0DJ93 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM13P0DJ93 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM13P0DJ93 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM13P0DJ93 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM13P0DJ93 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM13P0DJ93 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM13P0DJ93 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM13P0DJ93 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM13P0DJ93 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM13P0DJ93 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM13P0DJ93 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM13P0DJ93 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM13P0DJ93 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM13P0DJ93 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM13P0DJ93 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM13P0DJ93 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM13P0DJ93 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM13P0DJ93 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM13P0DJ93 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms