Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTSLP07711 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTSLP07711 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTSLP07711 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTSLP07711 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTSLP07711 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTSLP07711 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTSLP07711 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CTSLP07711 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTSLP07711 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTSLP07711 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTSLP07711 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTSLP07711 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTSLP07711 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTSLP07711 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTSLP07711 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTSLP07711 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTSLP07711 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTSLP07711 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTSLP07711 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTSLP07711 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTSLP07711 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTSLP07711 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTSLP07711 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTSLP07711 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTSLP07711 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTSLP07711 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTSLP07711 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTSLP07711 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CTSLP07711 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTSLP07711 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTSLP07711 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTSLP07711 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTSLP07711 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTSLP07711 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTSLP07711 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTSLP07711 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTSLP07711 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTSLP07711 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTSLP07711 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTSLP07711 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTSLP07711 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTSLP07711 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTSLP07711 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTSLP07711 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTSLP07711 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTSLP07711 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTSLP07711 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTSLP07711 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTSLP07711 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTSLP07711 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CTSLP07711 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTSLP07711 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTSLP07711 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTSLP07711 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTSLP07711 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTSLP07711 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTSLP07711 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTSLP07711 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTSLP07711 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTSLP07711 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTSLP07711 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTSLP07711 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTSLP07711 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTSLP07711 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTSLP07711 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTSLP07711 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTSLP07711 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSLP07711 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSLP07711 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSLP07711 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSLP07711 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSLP07711 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSLP07711 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSLP07711 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSLP07711 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSLP07711 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSLP07711 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSLP07711 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSLP07711 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSLP07711 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSLP07711 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSLP07711 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSLP07711 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTSLP07711 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTSLP07711 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTSLP07711 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTSLP07711 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTSLP07711 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTSLP07711 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTSLP07711 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTSLP07711 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTSLP07711 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTSLP07711 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTSLP07711 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTSLP07711 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTSLP07711 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTSLP07711 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTSLP07711 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CTSLP07711 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms