Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HLA-DOAP06340 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms