Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms