Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
DDX58O95786 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
DDX58O95786 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
DDX58O95786 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
DDX58O95786 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
DDX58O95786 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
DDX58O95786 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX58O95786 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX58O95786 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX58O95786 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX58O95786 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX58O95786 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX58O95786 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX58O95786 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX58O95786 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX58O95786 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX58O95786 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX58O95786 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX58O95786 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX58O95786 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX58O95786 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX58O95786 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX58O95786 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX58O95786 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX58O95786 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX58O95786 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX58O95786 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX58O95786 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX58O95786 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX58O95786 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX58O95786 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX58O95786 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX58O95786 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX58O95786 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX58O95786 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX58O95786 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX58O95786 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX58O95786 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX58O95786 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX58O95786 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX58O95786 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX58O95786 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX58O95786 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX58O95786 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX58O95786 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX58O95786 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX58O95786 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX58O95786 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX58O95786 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX58O95786 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX58O95786 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX58O95786 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX58O95786 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX58O95786 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX58O95786 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX58O95786 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX58O95786 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX58O95786 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX58O95786 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX58O95786 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX58O95786 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX58O95786 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX58O95786 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX58O95786 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX58O95786 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX58O95786 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX58O95786 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX58O95786 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX58O95786 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX58O95786 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX58O95786 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX58O95786 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX58O95786 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX58O95786 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX58O95786 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX58O95786 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX58O95786 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX58O95786 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX58O95786 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX58O95786 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX58O95786 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX58O95786 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX58O95786 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
DDX58O95786 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX58O95786 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX58O95786 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX58O95786 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX58O95786 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX58O95786 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX58O95786 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX58O95786 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX58O95786 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX58O95786 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX58O95786 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX58O95786 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX58O95786 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX58O95786 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX58O95786 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX58O95786 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX58O95786 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms