Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC31.46■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC31.41■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms