Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPINO95295 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms