Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms