Protein–RNA interactions for Protein: O43448

KCNAB3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB3O43448 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms