Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
J3KT08 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
J3KT08 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
J3KT08 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
J3KT08 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
J3KT08 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
J3KT08 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
J3KT08 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
J3KT08 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
J3KT08 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
J3KT08 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
J3KT08 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
J3KT08 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
J3KT08 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
J3KT08 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
J3KT08 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
J3KT08 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
J3KT08 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
J3KT08 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
J3KT08 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
J3KT08 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
J3KT08 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
J3KT08 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
J3KT08 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
J3KT08 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
J3KT08 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
J3KT08 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
J3KT08 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
J3KT08 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
J3KT08 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
J3KT08 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
J3KT08 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
J3KT08 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
J3KT08 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
J3KT08 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
J3KT08 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
J3KT08 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
J3KT08 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
J3KT08 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
J3KT08 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
J3KT08 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
J3KT08 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
J3KT08 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
J3KT08 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
J3KT08 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
J3KT08 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
J3KT08 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
J3KT08 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
J3KT08 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
J3KT08 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
J3KT08 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
J3KT08 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
J3KT08 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
J3KT08 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
J3KT08 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
J3KT08 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
J3KT08 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
J3KT08 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
J3KT08 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
J3KT08 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
J3KT08 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
J3KT08 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
J3KT08 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
J3KT08 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
J3KT08 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
J3KT08 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
J3KT08 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
J3KT08 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
J3KT08 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
J3KT08 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
J3KT08 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
J3KT08 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
J3KT08 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
J3KT08 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
J3KT08 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
J3KT08 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
J3KT08 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
J3KT08 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
J3KT08 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
J3KT08 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
J3KT08 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
J3KT08 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
J3KT08 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
J3KT08 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
J3KT08 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
J3KT08 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
J3KT08 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
J3KT08 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
J3KT08 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
J3KT08 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
J3KT08 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
J3KT08 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
J3KT08 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
J3KT08 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3KT08 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3KT08 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3KT08 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3KT08 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3KT08 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3KT08 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms