Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms