Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms