Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 517.1 ms