Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6S5

IGKV1-27, Immunoglobulin kappa variable 1-27, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-27A0A075B6S5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGKV1-27A0A075B6S5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IGKV1-27A0A075B6S5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IGKV1-27A0A075B6S5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
IGKV1-27A0A075B6S5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IGKV1-27A0A075B6S5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IGKV1-27A0A075B6S5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV1-27A0A075B6S5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV1-27A0A075B6S5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV1-27A0A075B6S5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV1-27A0A075B6S5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV1-27A0A075B6S5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV1-27A0A075B6S5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV1-27A0A075B6S5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV1-27A0A075B6S5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV1-27A0A075B6S5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV1-27A0A075B6S5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV1-27A0A075B6S5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV1-27A0A075B6S5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV1-27A0A075B6S5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV1-27A0A075B6S5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms