Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
MAP3K4Q9Y6R4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
MAP3K4Q9Y6R4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
MAP3K4Q9Y6R4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
MAP3K4Q9Y6R4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
MAP3K4Q9Y6R4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
MAP3K4Q9Y6R4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
MAP3K4Q9Y6R4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
MAP3K4Q9Y6R4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
MAP3K4Q9Y6R4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
MAP3K4Q9Y6R4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
MAP3K4Q9Y6R4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
MAP3K4Q9Y6R4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
MAP3K4Q9Y6R4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
MAP3K4Q9Y6R4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
MAP3K4Q9Y6R4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
MAP3K4Q9Y6R4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.93
MAP3K4Q9Y6R4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
MAP3K4Q9Y6R4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
MAP3K4Q9Y6R4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
MAP3K4Q9Y6R4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
MAP3K4Q9Y6R4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
MAP3K4Q9Y6R4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
MAP3K4Q9Y6R4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
MAP3K4Q9Y6R4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
MAP3K4Q9Y6R4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
MAP3K4Q9Y6R4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
MAP3K4Q9Y6R4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
MAP3K4Q9Y6R4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
MAP3K4Q9Y6R4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
MAP3K4Q9Y6R4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
MAP3K4Q9Y6R4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
MAP3K4Q9Y6R4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
MAP3K4Q9Y6R4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
MAP3K4Q9Y6R4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
MAP3K4Q9Y6R4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
MAP3K4Q9Y6R4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
MAP3K4Q9Y6R4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
MAP3K4Q9Y6R4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
MAP3K4Q9Y6R4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
MAP3K4Q9Y6R4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
MAP3K4Q9Y6R4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
MAP3K4Q9Y6R4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
MAP3K4Q9Y6R4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
MAP3K4Q9Y6R4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
MAP3K4Q9Y6R4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
MAP3K4Q9Y6R4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
MAP3K4Q9Y6R4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
MAP3K4Q9Y6R4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC33.33■■■□□ 2.93
MAP3K4Q9Y6R4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
MAP3K4Q9Y6R4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
MAP3K4Q9Y6R4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
MAP3K4Q9Y6R4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
MAP3K4Q9Y6R4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
MAP3K4Q9Y6R4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
MAP3K4Q9Y6R4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC33.31■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC33.3■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms