Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms