Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms