Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
HPS5Q9UPZ3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HPS5Q9UPZ3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms