Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPT9

USP22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22Q9UPT9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
USP22Q9UPT9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
USP22Q9UPT9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
USP22Q9UPT9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
USP22Q9UPT9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP22Q9UPT9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP22Q9UPT9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP22Q9UPT9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP22Q9UPT9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP22Q9UPT9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP22Q9UPT9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP22Q9UPT9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP22Q9UPT9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP22Q9UPT9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP22Q9UPT9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP22Q9UPT9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP22Q9UPT9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP22Q9UPT9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP22Q9UPT9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
USP22Q9UPT9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP22Q9UPT9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP22Q9UPT9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP22Q9UPT9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP22Q9UPT9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP22Q9UPT9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP22Q9UPT9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP22Q9UPT9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP22Q9UPT9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP22Q9UPT9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms