Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms