Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC30.76■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC30.73■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
IFT172Q9UG01 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
IFT172Q9UG01 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
IFT172Q9UG01 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
IFT172Q9UG01 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
IFT172Q9UG01 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
IFT172Q9UG01 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
IFT172Q9UG01 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
IFT172Q9UG01 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
IFT172Q9UG01 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
IFT172Q9UG01 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
IFT172Q9UG01 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
IFT172Q9UG01 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
IFT172Q9UG01 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
IFT172Q9UG01 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
IFT172Q9UG01 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
IFT172Q9UG01 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
IFT172Q9UG01 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
IFT172Q9UG01 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
IFT172Q9UG01 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
IFT172Q9UG01 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms