Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY6

TRIM10, Tripartite motif-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM10Q9UDY6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM10Q9UDY6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms