Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TVP23BQ9NYZ1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms