Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms