Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR77

PXMP2, Peroxisomal membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXMP2Q9NR77 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PXMP2Q9NR77 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PXMP2Q9NR77 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PXMP2Q9NR77 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PXMP2Q9NR77 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PXMP2Q9NR77 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PXMP2Q9NR77 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PXMP2Q9NR77 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PXMP2Q9NR77 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PXMP2Q9NR77 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PXMP2Q9NR77 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PXMP2Q9NR77 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PXMP2Q9NR77 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PXMP2Q9NR77 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PXMP2Q9NR77 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PXMP2Q9NR77 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PXMP2Q9NR77 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PXMP2Q9NR77 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PXMP2Q9NR77 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PXMP2Q9NR77 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PXMP2Q9NR77 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PXMP2Q9NR77 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PXMP2Q9NR77 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PXMP2Q9NR77 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PXMP2Q9NR77 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PXMP2Q9NR77 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PXMP2Q9NR77 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PXMP2Q9NR77 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PXMP2Q9NR77 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PXMP2Q9NR77 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PXMP2Q9NR77 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PXMP2Q9NR77 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PXMP2Q9NR77 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PXMP2Q9NR77 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PXMP2Q9NR77 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PXMP2Q9NR77 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms