Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms