Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NRIP3Q9NQ35 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms