Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms