Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBU9

POPDC2, Popeye domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POPDC2Q9HBU9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POPDC2Q9HBU9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POPDC2Q9HBU9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POPDC2Q9HBU9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POPDC2Q9HBU9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POPDC2Q9HBU9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POPDC2Q9HBU9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POPDC2Q9HBU9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POPDC2Q9HBU9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POPDC2Q9HBU9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POPDC2Q9HBU9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POPDC2Q9HBU9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POPDC2Q9HBU9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POPDC2Q9HBU9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POPDC2Q9HBU9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POPDC2Q9HBU9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POPDC2Q9HBU9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POPDC2Q9HBU9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POPDC2Q9HBU9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POPDC2Q9HBU9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POPDC2Q9HBU9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POPDC2Q9HBU9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POPDC2Q9HBU9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POPDC2Q9HBU9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POPDC2Q9HBU9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POPDC2Q9HBU9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POPDC2Q9HBU9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POPDC2Q9HBU9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POPDC2Q9HBU9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POPDC2Q9HBU9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POPDC2Q9HBU9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POPDC2Q9HBU9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POPDC2Q9HBU9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POPDC2Q9HBU9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POPDC2Q9HBU9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POPDC2Q9HBU9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POPDC2Q9HBU9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POPDC2Q9HBU9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms