Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms