Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms