Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms