Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LSM14BQ9BX40 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms