Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms