Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms